Село Забойки згадується в архівних джерелах як вимерле за доби Визвольної війни Богдана Хмельницького. Не від військових дій, а від якоїсь хвороби тоді у селі залишилося лише 6 осіб.

Парафія була греко-католицькою до 1946 року. Відновлено її у лоні УГКЦ у 1991 році.

Храм збудовано у 1897 році за пожертви парафіян УГКЦ. У новітній час храм розписали у 1993 році, іконостас виконав Василь Бронецький у 2005 році. У 1946—1990 роках в селі діяла підпільна громада УГКЦ. Тоді храм використовувала громада РПЦ але до її самоліквідації та утворення двох громад: УГКЦ та УАПЦ.

У 2011 році парафію візитував теперішній архиєпископ і митрополит Тернопільсько-Зборівський владика Василій Семенюк.

На парафії діють Вівтарна і Марійська дружини, братство Матері Божої Неустанної Помочі та спільнота «Матері в молитві».

На території парафії є три придорожні хрести та три фігури.

До майна, яке є у власності парафії, належить парафіяльний дім (проборство).

Парохи:

• о. Тимофій Бордуляк (1930-ті),
• о. Мирон їжак (1937—1944),
• о. Ігор Возьняк (1991),
• о. Йосафат Говера (1991—1992),
• о. Роман-Любомир Кузьменко (1992—1994),
• о. Василь-Олег Кривобочок (1994—1995),
• о. Тарас Юречко (з 1995).