У часи підпільної УГКЦ у с. Конотопи греко-католицькі священики відправляли Служби Божі в родинах (у приватних будинках).

З 1991 р. парафіяни почали роботи з відновлення храму. Офіційний вихід з підпілля, 1991 р. пройшов без конфліктів. У 1992 р. у храмі відбулося перше Богослужіння.

Обслуговував тоді парафію о. Володимир Вітт, після нього служив о. Іван Пиріг.